Posted 25 мая 2020, 17:27
Published 25 мая 2020, 17:27
Modified 7 марта, 14:56
Updated 7 марта, 14:56
В новом исследовании ученых из Университетского колледжа Лондона и Оксфордского университета, опубликованном на ресурсе bioRxiv, были изучены вирусные геномы более чем 15 000 пациентов COVID-19 из 75 стран мира.
Ирина Зиганшина
Главный вывод авторов, которые стремились выяснить, может ли какая-либо из мутаций сделать вирус более заразным или смертельным, такой: ни одна из мутаций, зарегистрированных в настоящее время в вирусе SARS-CoV-2, по-видимому, не увеличивает его трансмиссивность.
Мутации в коронавирусах могут происходить по разным причинам: из-за ошибок копирования во время репликации, из-за взаимодействия с другими вирусами, заражающими ту же клетку, или же под влиянием РНК хозяина, которая в результате иммунного ответа модифицирует вирус. Большинство мутаций нейтральны, другие могут быть полезными или вредными для вируса. И если вредная мутация уменьшает шансы вируса на выживание, то нейтральная или полезная могут стать распространенными, поскольку вирус передает их своим «потомкам».
Авторы нового исследования, изучив глобальную базу данных, выявили 6 822 мутации в SARS-CoV-2.273 мутации, как выяснилось, происходили неоднократно и независимо друг от друга. Из них ученые выбрали для более детального изучения 31 мутацию, которая в ходе пандемии произошла по меньшей мере 10 раз независимо друг от друга.
Чтобы проверить, увеличивают ли мутации передачу несущего их вируса, исследователи смоделировали эволюционное древо вируса и выяснили, становится ли конкретная мутация более распространенной в конкретной ветви эволюционного древа – то есть превосходят ли «потомки» этого вируса своих «близких родственников», у которых этой мутации нет. Однако никаких доказательств того, что какие-либо из распространенных мутаций увеличивают трансмиссивность вируса, не обнаружилось. Оказалось, что некоторые распространенные мутации нейтральны, а большинство – даже немного вредны для вируса.
В числе проанализированных мутаций была и мутация в вирусном спайковом белке под названием D614G – ранее предполагалось, что она способна сделать вирус более трансмиссивным. Новые данные показали, что и эта мутация не связана с усиленной передачей вируса.
Большинство распространенных мутаций, обнаружили исследователи, по-видимому, вызваны влиянием иммунной система человека, а не адаптацией вируса к его новому человеческому хозяину.
Как резюмируют авторы работы, можно ожидать, что в процессе мутаций, все более распространяясь среди людей, вирус разойдется на разные линии. Но это не означает, что какие-то из новых линий будут более передаваемыми или опасными.