Президент Владимир Путин подписал указ «Вопросы Федеральной таможенной службы», который устанавливает, что руководство службой осуществляет правительство Российской Федерации. Службе передаются функции Министерства экономического развития и торговли по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в области таможенного дела.